医院重点建设学科，是以各类脑肿瘤、脑神经疾病、脑血管病的手术和介入治疗为重点的综合神经外科。下设三个部7个子学科：外科i部（含外一科（颅底神经外科）、外二科（肿瘤神经外科））；外科ii部（含外六科（微侵袭神经外科）、外七科（血管神经外科）；外科iii部（含外三科（小儿神经外科）、外五科（综合神经外科））。
学科依托国内第一台美国4d公司生产的价值2500万元脑磁图大脑功能与定位检测仪、日本光电公司出品的超大阵列37台最新高分辨率视频脑电监测系统，飞利浦公司1.5t及ge3.0t功能磁共振仪和64排128层全身ct、大型dsa、法国rosa手术机器人，德国博医来手术导航系统、6台（套）世界最先进的神经外科手术显微镜和麻醉机、呼吸机、监护仪、美国产新型接触式半导体激光刀等过内现金的手术室环境和配套设备，在颅内巨大脑膜瘤、听神经瘤、垂体瘤、岩斜肿瘤、松果体肿瘤、脑干肿瘤、复杂动脉瘤等、颅脑损伤、脑血管病等疾病的外科治疗方面颇有建树，手术成功率高。
