感染性疾病科是以收治小儿消化系统、呼吸系统、中枢神经系统等感染性疾病及川崎病为主的科室。科室开放床位90张，分为感染1科、感染2科。 感染性疾病科拥有一支由高、中、初级职称人员组成，结构合理的专业技术队伍。对小儿消化系统、呼吸系统、中枢神经系统等感染性疾病、手足口病危重症、川崎病、结核病及发热原因待查等的诊治水平在全省处于领先地位。我科在全省有很高的知名度，是昆明市重点学科。我院是 云南省、昆明市收治重症手足口病、小儿结核病的定点医院，我科是云南省、昆明市收治重症手足口病、小儿结核病的定点科室。科室在多次参加昆明市突发公共卫生事件的工作中，发挥了重要作用。科室坚持以病人为中心，全心全意为病人服务的宗旨，尽量争取以最好的治疗方法、优质的服务，使患儿早日康复。
医护人员在繁忙的医疗工作中，积极撰写医学论文及科研工作。全科先后共撰写医学论文、病例报导120余篇发表在省级或省级以上医学期刊。科研“小儿纤维胃镜（超细型）在小儿上消化道疾病诊治中的研究”获2000年昆明市科技进步三等奖；参与中国cdc完成的“我国病毒性腹泻的病源学及流行病学研究“获2007年中国预防医学会科技进步贰等奖；参与完成的“昆明地区13286例儿童手足口病病原分析及ev71分子流行病学分析”获2011年昆明市科技进步二等奖；科室完成的“1764例手足口病的临床特点及病原学研究”分别获2011年昆明市、云南省科技进步三等奖。
科室特色技术：
1)科室拥有13c呼气试验仪器，无创性检测儿童胃幽门螺杆菌感染的金标准方法，方法简便、易行。对儿童长期腹痛、幽门螺杆菌感染的诊断、治疗提供有力的依据。
2)我院为云南省、昆明市收治重症手足口病定点医院，我科为定点科室，经过6年多的诊治手足口病中，我们发现所有危重型手足口病均有高血压，在脱水降颅压、抗病毒的同时，积极治疗、控制高血压，明显提高危重型手足口病的抢救成功率，明显降低了危重型手足口病的死亡率。酚妥拉明为一线治疗、控制高血压的治疗用药，硝普钠为二线用药。
3)呼吸机治疗危重型手足口病，当危重型手足口病出现呼吸衰竭、肺出血时应积极应用呼吸机辅助治疗，抢救患儿生命，我科拥有2台呼吸机。今年(2014年)1-11月共收治住院手足口病患儿1677例，重症病例1389例；重症病例中危重型1026例，呼吸机治疗26例，死亡1例。科室大部分医护人员掌握了呼吸机运用。
4)ppd试验 每周二、五上午做，对小儿结核病、结核感染的诊断有很好的参考价值。
5)目前川崎病己成为小儿后天性心脏病的最主要病因，科室对川崎病的早期诊断、治疗水平处于省内领先，随访病人多。
